As bactérias são organismos microscópicos unicelulares, vivem em todos os ambientes, como: no solo, na água do mar e nas profundezas da crosta da Terra.

Muitas bactérias vivem sobre e dentro do corpo, sobre a pele, nas vias respiratórias, na boca e nos tratos digestivo, reprodutivo e urinário, sem causar nenhum dano (microbioma).

Muitas floras habituais são efetivamente úteis para os individuos. Apenas alguns tipos de bactérias causam doenças. Elas são chamadas de patógenos.